8. Region of Interest
8. Region of Interest: 관심영역 포토샵 등에서 이미지를 처리할 때, 대부분 특정 부분을 선택하여 처리합니다. 눈을 키운다던가, 볼 터치를 화사하게 한다던가, 보기 싫은 뾰루지를 지우던가 하죠. 이렇게 이미지 프로세싱을 적용할 특정 영역을 관심영역(ROI: Region of Interest)라고 합니다. ImageJ에서는 ROI를
Category: Tutorial
7. Batch Processing
7. Batch Processing: 이미지 일괄 처리Reference A Fiji Scripting Tutorial #3. Inspecting properties and pixels of an image 대량의 이미지를 한번에 처리해야 하는 경우, 이미지를 하나 하나 불러오는 것보다 일괄처리가 효과적입니다. 이미지가 모여 있는 폴더를 지정할 수도
6. Image Data 분석
6.1. ImagePlus: ImageJ의 이미지 instanceReference TCP School 26) 클래스의 개념ImagePlus 지난 글에서 객체지향 프로그래밍(OOP: Object Oriented Programming)의 개념을 짧게 설명했습니다. instance란 것은 Class에 정의된 대로 만들어진 객체입니다. 자동차 설계도(Cla
5. Python Script 작성
5.1. ImageJ Script 예시Reference A Fiji Scripting Tutorial #3. Inspecting properties and pixels of an imageA Fiji Scripting Tutorial #4. Finding the java documentation for any class Javadocs: ImageJ1,
4. Python Basic
4.1. Python 문법을 공부하는 이유 ImageJ에서 활용하는 jython은 Java Virtual Machine (JVM) 위에서 python을 구현한 것입니다. 주로 web 환경에 많이 사용되는 JVM과 python의 연동이 자유로워 Java Class와 .jar 파일을 아무런 변환이나 노력 없이 그대로 끌어다 사용할 수 있다는 장점이 있습니다
3. ImageJ Python 개발 환경
ImageJ Jython 개발 환경을 설정하겠습니다. ImageJ에서는 통합개발환경(IDE)을 제공하지 않아 유사한 환경을 만들어줘야 합니다. Reference A Fiji Scripting Tutorial #2. Your first Fiji script 3.1. Image 불러오기 앞서 드린 설명에 따라 Boat.gif 이미지를 띄웁니다.
2. Image File 구조
여러분이 다룰 Image File의 구조를 간략하게 살펴보겠습니다. 최대한 간결하게 필수적인 지식만 전달하고자 합니다. Reference A Fiji Scripting Tutorial #2. Your first Fiji script 2.1. Image File 구조 ImageJ로 다룰 image는 bitmap 형식입니다. 전체 이미지는
1. ImageJ 설치
1.1. 아래 링크에서 ImageJ-Fiji를 다운로드 받습니다. Download Link : https://imagej.net/Fiji/Downloads 여기서는 Windows-64bit 버전을 기준으로 하겠습니다. 1.2. 압축을 풀면 다음과 같이 Fiji.app 폴더 안에 프로그램이 담겨 있습니다. C:\Program Files에 복사하